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<html>

<head>

</head>

<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">

Dear R-Langs,<br>

<br>

I'm currently trying to analyze some experimental data with a contrast

coded mixed model. I have a 2 (levels:A,B) x 3 (levels:D,E,F) design

with unbalanced cell sizes. I am coding the following variables:<br>

<br>

AvB, DvE, EvF<br>

<br>

where sum(AvB)=0, sum(DvE)=0, sum(EvF)=0. Next I fit this model:<br>

<br>

lmer(DV~AvB*(DvE+EvF)+(1|Subj)+(1|Item))<br>

<br>

And here is the correlation matrix it outputs:<br>

<br>

Correlation of Fixed Effects:<br>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Intr)&nbsp;&nbsp; AvB&nbsp;&nbsp;&nbsp; DvE&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; EvF&nbsp; AvB:DvE<br>

AvB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -0.029&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

DvE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.010 -0.006&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

EvF &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -0.002 -0.001&nbsp; <b><font color="#cc0000">0.488</font>&nbsp;&nbsp;</b>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

<br>

AvB:DvE -0.003&nbsp; 0.015 -0.039 -0.018&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

AvB:EvF -0.001 -0.002 -0.018 -0.044&nbsp; <font color="#000099"><b>0.488 </b></font><br>

<br>

The question I have is, how to get rid of the collinearity in red and

blue and whether it's even possible. And if it's not possible, in what

way will this affect the reliability of my result?<br>

<br>

Thanks so much in advance,<br>

<br>

Peter<br>

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